Eletroforese em gel na qual a direção do campo elétrico é alterada periodicamente. Esta técnica é
similar a outros
métodos eletroforéticos normalmente utilizados para separar a dupla fita das moléculas de
DNA de variáveis tamanhos até dezenas de milhares de pares de bases. Contudo, pela alternância da direção do campo elétrico é possível separar moléculas de
DNA de comprimentos de até vários milhões de pares de bases.